СВЯТО-ТРОИЦКИЙ МУЖСКОЙ МОНАСТЫРЬ в г. Алатырь основан на берегу р. Алатырь в период правления Ивана Грозного (первое упоминание под 1569/70). В Смуту подвергся разорению и вследствие бедствен. положения в 1615 приписан к Троице-Сергиевой лавре. С 1764 стал самостоятел. монастырём 3-го класса, в него были переведены монахи из упразднённой Преображенской Старцеугловской пустыни Алатыр. у. С 1612 управлялся строителями-игуменами, в 1765–82 и с 1798 – архимандритами, в 1782–98 – игуменами. В 1630–34 игуменом был церковный писатель С. Азарьин.

До сер. 18 в. все строения монастыря были деревянными. В 1748–54 построены двухэтаж. камен. Троицкая церковь, в 1797–1800 – Сергиевская, в 1-й пол. 19 в. – трёхъярус. колокольня, камен. покои настоятеля, кельи для монахов, братский корпус с трапезной, хозяйствен. постройки и др. Монастырь расширял свои угодья, в т.ч. за счёт захвата земель мордов. крестьян, превратившись в крупного землевладельца. В сер. 18 в. ему принадлежало 8484,5 дес. земли, 1886 дес. сенокосов, более 5,2 тыс. крестьян муж. пола и бобылей в Алатыре, 10 сёлах (Ичиксы, Кладбищи, Кувакино, Мирёнки, Мишуково, Сурский Майдан, Тургаково, Четвертаково, Чуварлей, Явлеи), д. Милютино и др., а также обшир. участки леса, рыб. ловли по р. Сура и во многих озёрах, мельницы и др. Часть доходов шла на содержание обитавших в монастыре отставных офицеров и солдат. После указа о секуляризации (1764) С.-Т.м.м. лишился многих угодий. В 1764 к монастырю были приписаны Казанская Ключевская пустынь (возникла в 1708 близ с. Четвертаково Ардатов. у., находилась под управлением монастыря) и в 1796 – Свято-Духовская пустынь. В нач. 20 в. монастырь владел 516 дес. земли в Алатыр., Ардатов. и Сызран. уездах, получал доходы от ценных бумаг; в нём было 13 монахов и 18 послушников.

С 1738–40 при монастыре действовала приготовительная школа Нижегород. архиерейской славяно-латин. школы, к-рая в 1778 преобразована в низшую духовную школу. Имелись богатая библиотека и архив с книгами и документами 17 – нач. 20 вв., книж. лавка. Глав. святынями являлись чудотвор. иконы Нерукотвор. Спаса и Казан. Божией Матери, мощи схимонаха Вассиана (обретены в 1748, утеряны в 1930-е гг.), над усыпальницей к-рого в 1848–49 построен придел Сергиев. церкви в честь Казан. Богоматери, в 1905 под приделом из усыпальницы устроена пещер. церковь. При пожаре 1906 сгорели все церкви (за исключением пещерной) и постройки монастыря, монахи были временно переселены в Свято-Духовскую пустынь.

В 1919 монастырь закрыт, в 1920 в нём создан концлагерь для принудительных работ. С 1930-х гг. на территории монастыря последовательно размещались тарный цех, гармон., махороч. и лыж. фабрики. В 1995–2000 передан Чебоксар. и Чуваш. епархии. Были проведены восстановител. работы, и обитель обрела историч. облик. Возрождены и построены церкви Казан. Божией Матери (1996), пещерная Серафима Саров­ского с источником Вассиана (1997), Сергия Радонежского (1998), соборная Живоначальной Троицы с нижним Покровским храмом (2006), апостола Варнавы (2007), архиерейский дом, корпуса с кельями для монахов, трапезная с гостиницей для паломников, хозяйствен. постройки и др. Возведена колокольня высотой 81,6 м. Действуют иконопис. мастерская, книж. лавка, библиотека, к-рая обслуживает и мирян. В 2001 открыт Рождествен. скит (подворье) в 15 км от Алатыря с церковью Рождества Хрис­това (2000). Настоятель монастыря епископ Алатырский и Порецкий Феодор. В 1995–2013 наместником монастыря был архимандрит Иероним (Шурыгин), с 2014 – игумен Софроний (Дубровин). В монастыре 55 монахов, 5 иноков и 7 послушников (2021).